Uno de los aspectos de mayor impacto y trascendencia en el sistema procesal penal acusatorio mexicano es la prueba como tema central en el proceso, regulada bajo los principios de la publicidad, contradicción, continuidad e inmediación, así como la trascendencia de la delimitación de su objeto, función y tema, la distinción de los datos, los medios y la prueba en sí misma.

La prueba debe ser lícita, de no ser así será excluida, sin valor legal alguno. Hoy en día se cuestiona el efecto reparatorio de esa exclusión. Luego, es importante su análisis a través de las teorías de vínculo atenuado, fuente independiente y descubrimiento inevitable. A fin de equilibrar en un Estado Democrático de Derecho, la tutela de los inocentes y la no impunidad de los culpables.

La implementación del esquema de libre valoración de la prueba que deja atrás al sistema tasado, pondera la racionalidad al órgano jurisdiccional a efecto de asignar valor a cada uno de los datos y pruebas, a través de las máximas de la experiencia, reglas de la lógica y principios científicos, pero siempre con la justificación de su valoración con base en la apreciación conjunta, integral y armónica de todos los elementos probatorios. Conforme a los nuevos criterios de la teoría relativa a la duda razonable.